Есть свежий сайт,  ещё без региональной привязки. Есть новая внутренняя страница на сайте, без единой внешней ссылки.  Страница попала в выдачу сегодня ночью. Т.о. никакой “старой” выдачи нет и быть не может (никаких кэшей пробивать не нужно). Есть 4 взаимодополняющих 2-3—словных низкоконкурентных запроса, по которым проверяются позиции в Яндексе  в выдаче для Москвы и Санкт-Петербурга.

В результате имеем следующие позиции: в Москве 4 первых места, а в Санкт-Петербурге только 3 первых места  и одно 8-е.

Вывод:   поиск  Яндекса не гомоморфен. Если проще, то рандомизация выдачи местами присутствует